作為 《世界運動禁藥法規》 簽約組織，中國香港運動禁藥管制機構有責任在香港執行一個符合國際標準的藥物檢測計劃。 本機構的藥物檢測計劃包括成立藥檢名單，向運動員收集樣本，安排將樣本送到世界運動禁藥機構認可的實驗室作化驗，以及執行結果管理。 

藥物檢測是有效打擊運動禁藥的阻嚇措施。檢測會在無預告的情況下於賽外或賽內進行。中國香港運動禁藥管制機構藥檢名單內的運動員，必須向本機構提交及更新行蹤資料，及會隨時隨地被挑選作檢測。此外，本機構會負責在本地體育賽事中執行賽內藥物檢測；亦會應本地體育總會及賽事主辦單位的委託，於香港舉行的本地及國際賽事執行藥物檢測。